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学校1958年开始招收五年制本科学生，1978年招收硕士研究生，是全国首批硕士学位授予单位，具有博士学位授予权。现有临床医学、基础医学、药学、生物医学工程、医学技术一级学科博士点和临床医学专业学位博士点，临床医学、护理学、中药学、生物学、生物医学工程、基础医学、中西医结合、药学、医学技术、口腔医学、公共卫生与预防医学、公共管理等12个一级学科硕士点，临床医学、生物医学工程、口腔医学、护理、药学、公共卫生、应用心理等7个专业硕士学位授权点；设有临床医学和药学一级学科博士后科研流动站。学校位列ESI全国高校综合排名第73位，临床医学、药理学与毒理学、生物学与生物化学、分子生物学与遗传学、材料科学、化学、神经科学与行为学、免疫学8个学科进入ESI全球排名前1%，其中临床医学专业进入ESI全球排名前1.21‰。拥有1个省部共建国家重点实验室、1个国家工程技术研究中心、1 个国家临床医学研究中心（眼科疾病）、1个国家药监局眼科疾病医疗器械和药物临床研究与评价重点实验室、2个教育部省部共建协枝闭同创新中心、2个国家国际科技合作基地、29个省部级科研平台。2个浙江省“重中之重一级学科”，3个浙江省A类一流学科、6个B类一流学科，10个浙江省高校重点学科，2个浙江省重点建设学科。,学校坚持以社会需求为导向，以百姓满意为宗旨，着力培养有情怀有自信、能做事能创新的优秀医学人才。学校现有30个本科招生专业，涉及医学、理学、工学、管理学等四大学科门类。有在校本专科生14439人（全日制，不含独立学院——温州医科大学仁济学院），研究生5279人（含博士研究生386人）猛困裂，学历教育留学生566人。学校已形成从本科生到硕士生、博士生及博士后，从全日制到成人教育、留学生和港澳台学生教育全方位、多层次的人才培养体系。人才培养质量稳步提升，临床医学类毕业生参加国家执业医师资格考试通过率一直位居全国前10%。据2021年省教育考试院数据，我校2020届毕业生用人单位满意度、2018届本科毕业生就业竞争力、毕业生母校满意度总项排名居省属本科院校第一。,学校现有教职员工及医护人员14000余人（含附属医院），其中具有高级专业技术职务1800余人。学校本部现有专任教师1698人，其中具有正高级专业技术职务444人，具有副高级专业技术职务578人，博士学位1273人。有中国工程院院士1人、加拿大健康科学院院士2人、国家“杰青”项目获得者2人；一批优秀人才入选“国家万人”、科技部中青年科技创新领军人才、省特级专家等，一批教师获国家科技进步奖、光华工程科技奖、何梁何利基金科学与技术奖、全国优秀教师、全国师德标兵、全国三八红旗手等荣誉。拥有教育部创新团队1个、全国高校黄大年式教师团队2个、科技部高等学校学科创新引智基地（111基地）2个。学校获评省重才爱才先进单位。,学校拥有国家特色专业建设点4个、国家级一流本科专业建设点16个、国家级教学团队1个、国家级人才培养创新实验区1个、国家级实验教学示范中心2个、国家级实践教育基地1个、国家临床教学培训示范中心1个、国家虚拟仿真实验教学中心1个、尺笑国家级精品资源共享课程5门、国家双语教学示范课程1门、国家级来华留学生英语授课品牌课程2门、国家精品在线开放课程2门、国家虚拟仿真实验教学项目6项，国家级线下一流课程2门、国家级线上线下混合式一流课程2门、国家级社会实践一流课程1门，获教育部“卓越医生教育培养计划”试点项目5个、国家专业综合改革试点项目1个；获国家级教学成果二等奖3项。,学校承担国家级科研项目1200余项，科研成果获得省部级以上奖励170余项，其中获国家科技进步奖一等奖1项，国家科技进步奖二等奖5项，国家技术发明奖二等奖2项，教育部科技奖一等奖1项、二等奖3项，中华医学科技奖一等奖5项，中国药学会科技奖一等奖1项，浙江省科学技术奖重大贡献奖1项，浙江省科学技术奖一等奖19项，教育部人文社会科学优秀成果奖一二三等奖各1项，全国教育科学研究优秀成果奖二等奖1项，浙江省哲学社会科学优秀成果奖一等奖4项。,学校积极推进教育国际化，先后与32个国家（地区）150多所高校和教育科研机构建立了良好的交流合作关系，其中包括20余所世界百强大学，在学生海外交流和联合培养、教师学术交流和科研合作、中外合作办学、来华留学生教育等方面开展了实质性的交流合作。现有中美眼视光学博士研究生教育项目、中美护理学本科教育项目、中瑞临床医学博士研究生教育项目、中泰护理学硕士学位教育项目与中韩药学专业博士学位教育项目等5个中外合作办学项目，其中2个被列为浙江省中外合作办学示范项目。与世界百强名校阿尔伯塔大学合作举办温州医科大学阿尔伯塔学院，是目前我国医学院校中外合作办学层次最高的机构。与波兰卢布林医科大学合作举办我国首个临床医学教育境外办学项目。入选国家留学基金委“青年骨干教师出国研修项目”实施院校、“浙江省国际化特色高校”首批建设单位。,学校现有3个校区，总占地面积约1900亩。图书馆馆藏文献约203万册。学校主办、编辑出版5种学术期刊、1种学术报刊，其中学术杂志《Eye and Vision》进入SCIE学术期刊，3种期刊入选“中国科技核心期刊”，《中华眼视光学与视觉科学杂志》为中华医学会系列杂志。学校拥有5所附属医院，其中4所为三级甲等医院，同时设有29所非直属附属医院（临床学院）。附属眼视光医院、附属第一医院、附属第二医院保持中国医院科技量值评价排行榜综合百强，附属眼视光医院连续3年综合排名全国眼科专科医院第1名，眼科学稳居全国第二。,学校秉持“仁肃勤朴、求是奋发”的校训，坚持特色立校、人才强校、文化兴校，逐渐形成了“以特色学科引领和带动全面发展，以推进国际化进程提升办学水平，以医疗和产学研一体化服务于地方经济社会发展”的办学特色，探索出了一条地方高等院校的强校之路。2021年，学校综合实力位列武书连中国大学排行榜第95位。